在中国科学院、广州分院和深圳市直属机关工委的关心指导下，先进院建立了党群组织，涵盖党组织、工会、团委、义工队、研究生会等组织。党群组织围绕中心工作，服从服务和促进大局，根据各自的职能，不断地发挥自身的作用，并致力于形成富有先进院特色的党群组织文化。

一、党组织基本情况

2007年1月11日，先进院成立了党总支，辖7个党支部，接受中国科学院党组和深圳市直属机关工作委员会的共同领导。

随着党员队伍不断壮大，在先进院顺利通过验收后，先进院于2010年3月召开党员大会，成立了第一届党委和纪委。党组织围绕中心，服务中心开展各项工作，充分发挥党员的先锋模范作用。截至2010年6月30日，先进院共建立了11个党支部，共有党员407名。党组织成功举办了“贺国庆院庆60周年――红歌汇”、广西捐教、“我看改革开放三十周年”主题报告会等党日活动。

二、工会组织基本情况

先进院工会成立于2007年4月9日，隶属深圳市直属机关工会，下设女工委、经费审查委员会及7个工会小组。截至2010年9月30日，共有会员482名。

先进院工会在发挥维护职工群众民主权益、吸引和组织职工群众参加院建设和改革，发挥职工群众参政议政等方面发挥了重要作用。趣味运动会、健身月、红歌汇、亲子活动等已成为选进院的传统活动；足球、篮球、羽毛球、乒乓球、摄影和文艺6个专业协会开展的丰富多彩的活动受到大家的欢迎。足球、篮球、羽毛球队多次在大学城运动会和其它院所及企业的比赛中获得佳绩。

三、团组织基本情况

先进院团委成立于2007年4月28日，隶属于深圳市直属机关团工委。先进院坚持以党建带团建，以团建促党建，充分发挥团组织团结教育青年的作用，努力做中国共产党的助手和后备军。

四、义工组织基本情况

先进院义工服务队成立于2006年12月6日，隶属于南山区义工联，在南山区义工联的带领下开展义工服务。坚持“服务社会，传播文明”的宗旨，发扬“参与、互助、奉献、进步”的义工精神。

五、研究生会基本情况

自2006年成立以来，历经三届。积极向上，带领全体学生用热忱、智慧与坚定构筑起先进院团结、奋进、朝气蓬勃、执着向上的氛围，在学术、科研、文化等方面都发挥了生力军的作用。